Первые сообщения о ЧП на Октябрьской железной дороге начали поступать около 22 часов 27 ноября. Сначала считалось, что причиной схода с рельс нескольких вагонов поезда стала авария. Однако уже спустя полтора часа специалисты уверенно заявили о теракте. Как сообщили «Новой» в пресс-службе Северо-Западного УВД на транспорте, 27 ноября около 21.40 во время движения поезда № 166 «Невский экспресс» сообщением Москва — Петербург произошел взрыв большой мощности. Это случилось после того, как состав прошел Бологое и подъезжал к станции Угловка. «Невский экспресс» вышел из Москвы, согласно расписанию, около 19 часов в пятницу и должен был прибыть в Петербург в этот же день в 23.30.

Петербургских журналистов, прибывших на место происшествия рано утром 28 ноября, за милицейское оцепление не пропустили, более того — их насильно отвели на значительное расстояние и держали в лесу. Ни подойти поближе и что-либо разглядеть, ни пообщаться с пассажирами поезда или работниками РЖД корреспондентам различных СМИ не разрешали сотрудники милиции, МЧС и ФСБ, ссылаясь на «особый режим» и «повышенную опасность».

По предварительным оценкам экспертов, взрыв, приведший к крушению, произошел под девятым по счету от головы состава вагоном. К обследованию воронки размером 1 на 2 метра, образовавшейся в результате взрыва, специалисты приступили утром 28 ноября. Как сообщили «Новой» сотрудники правоохранительных органов, находившиеся на месте катастрофы, основная ударная волна пришлась на четыре последних вагона. По словам очевидцев, «один вагон лежал примерно в трехстах метрах от воронки», второй — на железнодорожном пути, два других накренились, но не упали.

28 ноября по факту крушения поезда № 166 «Невский экспресс» Генпрокуратура возбудила уголовное дело по части 3 статьи 205 (террористический акт) и статьи 222 (незаконный оборот взрывных устройств и взрывчатых веществ) УК РФ. На всей ветке ОЖД Санкт-Петербург — Москва с полуночи ввели режим «Тайфун». Весь личный состав подразделений транспортной милиции обеих столиц был поднят по тревоге.

Всю ночь 28 ноября на Московском вокзале Петербурга родственники пассажиров «Невского экспресса» ждали своих близких. Здесь же дежурили 20 бригад «Скорой помощи» и еще больше милицейских нарядов. Из-за дефицита информации началась паника. О том, что случилось, встречающие узнавали лишь от членов своих семей — петербуржцы, ехавшие в поезде № 166 и оставшиеся в живых, звонили родным на вокзал. Они рассказывали, что почти во всех вагонах разбиты стекла, по составу ходят проводники и собирают обезболивающие таблетки для травмированных.

Большую часть пассажиров РЖД оперативно доставило в Петербург рано утром 28 ноября на скоростном поезде «Сапсан». Прямо с поезда 22 пострадавших с тяжелыми травмами на машинах «скорой помощи» были доставлены в больницы города. По информации петербургского центра МЧС, 50 пострадавших остались в больницах Тверской области. Всего к середине дня субботы были госпитализированы 72 пассажира.

Официальный представитель Генпрокуратуры на месте ЧП Марина Гриднева заявила, что на 14.00 часов 28 ноября число погибших пассажиров «Невского экспресса» достигло 30 человек, пострадавших — 96. Всего же, по информации пресс-службы РЖД, на поезд № 166 приобрели билеты 682 человека. В 11.30 в субботу на сайте РЖД появился список из 95 фамилий пассажиров поезда, которые обратились за медицинской помощью в лечебные учреждения. Имена погибших в списке указаны не были. Их также не могли назвать ни по горячим телефонам, ни в оперативном штабе на Московском вокзале в Петербурге. В субботу днем здесь с достоверностью утверждали только об одном погибшем — мужчине по фамилии Лазаренко.

Примерно в это же время стало известно о том, что при крушении «Невского экспресса» погиб председатель правления «Росавтодор», бывший сенатор от Петербурга в Совете Федерации, бывший вице-губернатор города Сергей Тарасов. «Согласно купленным билетам», он ехал в вагоне № 1, находившемся в хвосте состава и пострадавшем больше других.

К вечеру субботы на Московском вокзале началось столпотворение: из-за аварии 52 поезда из Москвы, Таллина, Хельсинки, Пскова, Мурманска, Петрозаводска и других городов опаздывали в Петербург на 8—10 часов.

Между тем уже 28 ноября о причастности к подрыву «Невского экспресса» неожиданно заявила независимая ячейка боевой автономной группы Сombat 18.

Представители Следственного комитета при Генпрокуратуре, работающие на месте происшествия, в настоящий момент не подтверждают, что взрыв на железной дороге — дело рук националистов. Следователи говорят, что они пока не располагают данными о том, что к аварии «Невского экспресса» может быть причастна какая-либо экстремистская группировка.